在正统道教神系中，玉皇大帝与西王母并非夫妻关系，西王母是先天阴气凝聚而成，是所有女仙之首、掌管昆仑仙岛。而所有男仙之首为先天阳气凝聚而成的东王公，其掌管蓬莱仙岛。
而玉皇为群仙之首，众神之主。西王母的出现比玉皇要早，所以他们不是夫妻。只有中国民间的故事和小说，才认为玉皇大帝和王母娘娘是夫妻。
西王母的概念在远古就有了，在战国至汉初写成的《山海经》中，“西王母其状如人，豹尾虎齿而善啸”，对这样一个怪物，天帝是不会有兴趣的。在《竹书纪年》和《穆天子传》中，西王母是人间的国王，不是神仙。西汉司马相如《大人赋》曰：“吾乃今日睹西王母，皓然白首。”把西王母看成为白发老妪。
东汉后期，道教在中国诞生，天帝和西王母都成为了道教所崇拜的神仙。道士们一代一代撰写了许多典籍，都没有这两位天神是夫妻关系的记载。
玉皇大帝，全称“昊天金阙无上至尊自然妙有弥罗至真玉皇上帝”，又称“昊天通明宫玉皇大帝”、“玄穹高上玉皇大帝”，居住在玉清宫。道教认为玉皇为众神之王，在道教神阶中修为境界不是最高，但是神权最大。玉皇上帝除统领天、地、人三界神灵之外，还管理宇宙万物的兴隆衰败、吉凶祸福。
西王母则被崇奉为“西元九灵上真仙母”，后来又加上了更复杂的“白玉龟台‘九灵太真金母元君”封号。西王母在道教经典中有一个对偶神叫“东木公”，西王母和东木公的关系比较密切，但只是互为镜像，不是配偶关系，而西王母和玉皇大帝则没有任何关系。
董永和织女的夫妻关系虽然没有流传起来，但却有文字支持，从干宝的《搜神记》到《清平山堂话本》，董永和织女的婚姻都是由玉皇大帝支配的，织女的母亲一方从来没有出过头。织女同牵牛的婚姻过程没有古籍记载，当然也同西王母无关。因为古人认识银河及牛郎织女星在先，信奉西王母在后，从逻辑上说也不会让西王母遣出一条银河出来。只在晋代有人说，织女同牵牛每年七月初七见一面，谁定的这规矩没有说，但肯定不是西王母，因为西王母不是玉皇大帝的皇后，而且两者的身份地位也不一样，一在天上，一在地上。
在宋太宗圣喻编制的《太平广记》中，还看不到西王母同玉皇大帝有关系，所以把西王母强行嫁给玉皇大帝的应该是南宋以后的剧作家和小说家。宋元明时期，许多文学家皆以西王母蟠桃会为题材，写入小说、戏曲中，据庄一拂《古典戏曲存目汇考》卷二称：“宋官本杂剧，即有《宴瑶池爨》。金元院本有《王母祝寿》一本，《蟠桃会》一本，《瑶池会》一本。元钟嗣成、明朱有炖俱有《蟠桃会》杂剧，情节皆类似。”如朱有炖《群仙庆寿蟠桃会》，“内容谓瑶池蟠桃结实，西王母召东华、南极、八仙，以及人间香山九老、洛下耆英等，开蟠桃大会。”小说中涉笔西王母事的也很多，吴承恩的《西游记》所写孙悟空大闹蟠桃会的故事，就是对上述剧本的进一步演绎，而且把西王母的户口从西方昆仑山迁到了天上，并给玉皇大帝作了皇后。
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