离子阱（jǐng）是一种将离子通过电磁场限定在有限空间内的设备。
被限定的离子处于“稳定区”。传统的离子阱通过调整电场参数，使离子进入“不稳定区”，继而从预制空间脱离离子阱。
离子阱大致分为三维离子阱、线性离子阱和轨道离子阱三种。
除轨道离子阱外，离子阱使用电磁场将离子限定在特定的空间内，通过改变电场的参数，使特定的离子进入不稳定状态，最终导致离子从预留的孔或窄缝中射出到达检测器。除轨道离子阱外，离子阱质量选择器因为其特有的空间限定特点，使其在多级质谱分析(MS-MS)中占据了重要的地位。
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