准分子激光手术的原理是用一种特殊的极其精密的微型角膜板层切割系统（简称角膜刀）将角膜表层组织制作成一个带蒂的圆形角膜瓣，翻转角膜瓣后，在计算机控制下，用准分子激光对瓣下的角膜基质层拟去除的部分组织予以精确气化，然后于瓣下冲洗并将角膜瓣复位，以此改变角膜前表面的形态，调整角膜的屈光力，达到矫正近视、远视或散光的目的。
通俗的讲就是相当于打磨，把凸起来的地方削平点。 近视主要是眼球晶状体变凸了，用激光把眼角膜瞳孔前的部分去掉薄薄的一层，改变光线的折射路径，抵消晶状体变凸部分的影响。由于眼角膜变薄了，所以要特别注意保护。
为确保安全和有效，准分子激光治疗近视眼要求患者术前屈光状态稳定，矫正视力达到0.5以上。据此，接受手术的最佳年龄应该在25岁至35岁，18周岁以下的青少年正处于身体生长期，眼睛屈光度不稳定，若盲目接受手术，一二年后视力极有可能回退，严重影响预期的疗效，功败垂成。
做激光准分子手术可能出现的弊端就是，可能会出现并发症，如感染、欠矫或过矫、角膜穿透、医源性角膜散光、继发性圆锥角膜、角膜瓣不规则、眩光等等。这些并发症如果没及时发现处理不得当，会留下后遗症，影响疗效。如术中角膜穿透或术后继发严重的圆锥角膜，令患者不得不接收角膜移植手术，给患者带来很大麻烦。
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