以下几方面因素均可影响小儿肠黏膜正常功能，使肠道对肠腔内电解质或水分转运失常，导致腹泻。
1.脏腑功能不完善
“稚阳未充，稚阴未长”，小儿脏腑娇嫩，形气未充，五脏六腑的功能状况不够稳定、未臻完善。脾主运化，小儿脾常不足，运化力弱，摄入的食物要软而易消化，饮食应有常、有节，否则易出现食积、吐泻。
2.饮食不当
喂养(量和成分)不合适，会引发小儿消化道功能紊乱，进而导致腹泻。如：小儿对于增添的离乳食品没有适应、辅食增添的品种太多太杂、骤然断奶、一次喂得太多、吃了不易消化的蛋白质食物等。气温较低时，孩子小腹易着凉，而天太热时，胃液分泌又会减少，这些情况下小儿都可能会发生腹泻。
3.肠道菌群失调
感染细菌、寄生虫、病毒等，会引发小儿消化道功能紊乱导致腹泻。此外，目前滥用抗生素的现象十分严重，这样会导致肠道菌群失调，刺激肠壁、影响肠道功能，使孩子食欲减退、腹泻迁延不愈等。
4.过敏因素
有些孩子对某些食物成分过敏，可表现为慢性腹泻。
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